La diferencia entre Novación y Subrogación, en esta última sólo se puede modificar el tipo de interés aplicable y/o el plazo del préstamo. Por tanto, en la subrogación, no se pueden realizar ampliaciones de capital o añadir titulares a la hipoteca, como si se puede hacer en la Novación.

En cuanto a los gastos, la Subrogación conlleva el pago de la Comisión de subrogación, Gastos de notaría, Registro de la Propiedad y Gestoría.

En general, los gastos por la subrogación de una hipoteca suelen ser mayores que los gastos de una Novación, por lo que conviene analizar previamente los gastos que supone cada operación y los posibles beneficios que se podrían obtener.